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科学家对抗严重急性呼吸综合征冠状病毒2

        2019年底至今,新型冠状病毒(2019-nCoV)大规模感染,对人民的生活造成极大的影响,科学家们也积极的了解病毒的特性, 传播途径并寻求治愈方式。新型冠状病毒正式命名为严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2),说明与SARS病毒为近亲, 而导致的疾病称COVID-19,CO代表冠状(Corona),VI代表病毒(virus),D代表疾病(disease)。COVID-19与历史上流行过的严重急性呼吸综合征(SARS)和中东呼吸综合征(MERS)同为冠状病毒引起,病毒感染人类需有特定的受体进行传播,了解病毒的结合受体与交互作用方式,将有助于严重急性呼吸综合征冠状病毒2的药物开发。

        与其他冠状病毒一样,严重急性呼吸综合征冠状病毒2的基因组编码了刺突蛋白(Spike protein: S)、包膜蛋白(Envelope protein: E)、膜蛋白(Membrane glycoprotein: M)和核衣壳蛋白(Nucleocapsid protein: N)等结构蛋白,组装后的病毒颗粒如(图一)。刺突蛋白介导与宿主的受体结合和膜融合。核衣壳蛋白是冠状病毒含量最丰富且通常是高度保守的蛋白,也是一种高免疫原性的磷蛋白,通常在诊断测定中用作标记。

(图一)

        冠状病毒的刺突蛋白是由三个高度糖基化的第一型膜蛋白—刺突蛋白所组成,刺突蛋白在N端含有一个信号肽(signal peptide),该信号肽使得刺突蛋白在内质网异位时被切割为细胞外结构域、跨膜结构域和胞质尾端,刺突蛋白可以分为两个功能不同的亚单元,S1是可溶性受体结合域(Receptor binding domain: RBD),负责识别并与细胞表面的受体结合,被认为是冠状病毒与宿主细胞结合的主要决定因素(图二);S2是膜锚定域,是结构中的「茎」,含有与宿主细胞膜融合所需的其他基本元素,推测具有一个融合肽(fusion peptide: FP)、两个七肽重复(heptad repeat: HR)区域,和一个C端跨膜结构域(图二)。

(图二)

        冠状病毒能够利用不同的细胞表面分子、蛋白质或碳水化合物作为受体,目前已知会感染人类呼吸道的七种冠状病毒与其受体如(表一)所示。

2019-nCoV

(表一)

        氨基肽酶N (aminopeptidase: APN),也称为CD13,被认为可能是β冠状病毒的一种广泛受体,但后来又发现HCoV-NL63可以像β冠状病毒SARS-CoV一样,利用血管紧张素转化酶2 (angiotensin-converting enzyme 2: ACE2)进入细胞,有些属的冠状病毒,能够利用细胞表面的碳水化合物(如唾液酸: sialic acid)进入,此外,钙依赖性凝集素 (lectin),例如树突状细胞特异性细胞间黏附分子3整合素(dendritic cell-specific intercellular adhesion
molecule-3-grabbing nonintegrin: DC-SIGN)也可以作为受体。

        冠状病毒进入宿主细胞涉及两个步骤,包括病毒和细胞受体结合与后续的膜融合,病毒-受体相互作用和宿主蛋白酶对于激活膜融合至关重要。通过S1-受体相互作用触发的S2融合域构型变化,导致将FP插入靶标细胞的细胞膜,接着HR1和HR2域结合形成六螺旋束的融合核心,S2亚单元内不同结构域之间的合作,吸引了病毒包膜与靶标细胞紧密贴合,从而实现膜融合,将病毒基因组释放到宿主的细胞质中(图三)。病毒与受体结合后启动病毒进入宿主的步骤,这是冠状病毒控制向性特异性的第一种策略,刺突-受体相互作用是高度特异性的,在受体结合域或受体上的受体结合界面发生细微的氨基酸变化,都可能会破坏病毒-受体相互作用。

2019-nCoV

(图三)

        激活酶融合的蛋白酶也可能导致病毒的发病机理,猪呼吸道冠状病毒(PEDV)偏好在充满蛋白酶的猪肠上皮中复制。另外,在非洲绿猴肾上皮细胞(Vero)中表达跨膜蛋白酶丝氨酸2 (TMPRSS2),可激活S融合蛋白来增强病毒进入,SARS-CoV的病患体内也被发现细胞中TMPRSS2的表达模型与肺上叶的感染相关,这表明胰蛋白酶和TMPRSS2可能是冠状病毒对宿主向性和诱发病程的决定因素(图三),已有尚在审查中的实验数据指出,严重急性呼吸综合征冠状病毒2可能通过与SARS-CoV相同的宿主受体ACE2和细胞蛋白酶TMPRSS2进入人类呼吸道上皮细胞。

        细胞焦亡(pyroptosis)是程序性细胞死亡的一种新型炎症形式,当宿主感测到感染时,会导致炎性小体活化,以及成孔蛋白gasdermin D的裂解,并伴随着细胞肿胀和破裂,促进炎性细胞因子IL-1β和IL-18释放,最后导致细胞焦亡。宿主介导的感染感测,包括NLRP1、NLRP3、NLRC4、NAIP、AIM2和Pyrin等炎症传感器(炎性小体),识别PAMPs (来自病原体)和DAMPs (如: β-淀粉样蛋白或重金属)后,引发一系列事件,最终导致炎症和细胞死亡(图四)。根据尚在审查中的实验数据指出,感染严重急性呼吸综合征冠状病毒2的患者血清中IL-1β升高,猜测严重急性呼吸综合征冠状病毒2可能会通过激活NLRP3炎性小体,引起细胞焦亡,并参与感染患者的发病机制,但仍需要更进一步证实。

2019-nCoV

(图四)

        冠状病毒的进入始于刺突蛋白与细胞表面靶标受体的结合,细胞膜融合后才将病毒遗传物质送入细胞(图五),因此刺突蛋白和受体常被当作开发中和抗体或是疫苗的靶标,如能阻止冠状病毒表面的刺突蛋白与受感染细胞上的受体结合,就能够防止病毒进入细胞,可能的策略有外加刺突蛋白的受体结合域去与宿主受体结合,或是使用宿主受体的中和抗体,因此没有能用的宿主受体让病毒结合,也可以直接使用宿主受体的细胞外域作为诱饵与刺突蛋白结合,直接靶向冠状病毒病毒体如(图五)。

(图五)

        目前尚未有疫苗可用来预防冠状病毒感染,因严重急性呼吸综合征冠状病毒2有包膜,可以用70-75%酒精做为个人或家庭的消毒,也可以用稀释的漂白水做环境的消毒,从流行病学信息来看,严重急性呼吸综合征冠状病毒2藉由近距离飞沫、直接或间接接触感染者的口鼻分泌物传染,勤用酒精消毒以及用肥皂洗手,必要时佩戴外科口罩,尽量避免出入人潮拥挤、空气不流通的公共场所,避免接触野生动物与禽类,并避免食用生食或未煮熟的动物制品,将有助于防堵疫情。

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